Кости черепа, соединяясь друг с другом, образуют большое количество полостей, углублений и ямок. На мозговом черепе различают верхнюю его часть — крышу черепа и нижнюю часть — основание черепа. Крыша черепа составлена теменными костями, отчасти лобной, затылочной и височными костями. Основание черепа образовано глазничными частями лобной кости, решетчатой, клиновидной, височными, а также затылочной костями.
В черепе представлены все виды соединения костей: непрерывные (швы, вколачивания, синхондрозы) и прерывные (височно-нижнечелюстной сустав). Швы крыши черепа в большинстве своем относятся к числу зубчатых. К ним принадлежат венечный шов между лобной и теменной костями, сагиттальный шов между правой и левой теменными костями и ламбдовидный шов между теменными и затылочной костями. Исключением является соединение чешуи височной кости с теменной костью, где одна кость, налегая на другую, образует так называемый чешуйчатый шов. Кости лица соединяются плоскими швами. Вколачивание характерно для соединения корня зуба альвеолами верхней и нижней челюстей с небольшой прослойкой соединительной ткани между ними. Синхондрозы расположены у детей между отдельными частями костей, а также между клиновидной и затылочной костями.
Височно — нижнечелюстной сустав образован мыщелковым отростком ветви нижней челюсти и нижнечелюстной ямкой височной кости. Сустав двухкамерный, комбинированный. Внутри него расположен суставной диск, который превращает сустав в двухкамерный и увеличивает возможность движений в нем. По форме сустав эллипсовидный, а по функции (благодаря наличию диска) — шаровидный. В височно-нижнечелюстном суставе возможны следующие движения: опускание и поднимание нижней челюсти, движения ее вперед, назад и в стороны. При прощупывании головки во время открывания и закрывания рта нетрудно убедиться в наличии этого движения. Сустав укреплен следующими связками: латеральной, которая находится снаружи сустава и идет от скулового отростка височной кости к шейке нижней челюсти, клиновидно-нижнечелюстной и шилонижнечелюстной, которые идут от соответствующих костей к нижней челюсти.
Отделив крышу черепа, можно изучить внутреннее основание черепа, которое подразделяется на три черепные ямки: переднюю, среднюю и заднюю.
В передней черепной ямке располагаются лобные доли полушарий большого мозга, в средней — височные доли, в задней — мозжечок, мост и продолговатый мозг. Каждая ямка имеет ряд отверстий. Передняя черепная ямка имеет отверстия решетчатой пластинки, сообщающие ее с полостью носа. Из средней черепной ямки верхняя глазничная щель и зрительный канал ведут в полость глазницы; круглое отверстие ведет в крыловидно-небную ямку и через нее в глазницу; овальное и остистое отверстие сообщают среднюю черепную ямку с наружным основанием черепа. В задней черепной ямке находится несколько отверстий: большое (затылочное), которое сообщает полость черепа с позвоночным каналом; яремное, ведущее на наружную поверхность основания черепа, и внутреннее слуховое, ведущей во внутреннее ухо.
Рассматривая череп снизу, можно видеть, что основание черепа в переднем его отделе закрыто костями лица, которые образуют костное небо, состоящее из небных отростков верхних челюстей и небных костей. В среднем и заднем отделах основание черепа образовано нижними поверхностями клиновидной, затылочной и височной костей. Они имеют большое количество отверстий, в частности яремное отверстие между затылочной и височной костям и рваное отверстие между каменистой частью височной кости и клиновидной костью.
Наиболее крупными топографо-анатомическими образованиями лицевого черепа являются глазница, носовая и ротовая полости. Глазница имеет форму четырехгранной пирамиды. Медиальная стенка ее образована лобным отростком верхней челюсти, слезной костью, глазничной пластинкой решетчатой кости и отчасти телом клиновидной кости; верхняя стенка — глазничной частью лобной кости, малыми крыльями клиновидной кости; латеральная стенка — большими крыльями клиновидной кости и скуловой костью; нижняя стенка — верхней поверхностью тела верхней челюсти. Глазница сообщается с полостью черепа через верхнюю глазничную щель и зрительный канал; с носовой—через носослезный канал, образованный слезной костью, лобным отростком верхней челюсти и нижней носовой раковиной; с подвисочной и крыловидно-небной ямками — при помощи нижней глазничной щели, которая расположена между большими крыльями клиновидной кости и телом верхней челюсти.
Носовая полость имеет верхнюю, нижнюю и боковые стенки. Она разделена костной перегородкой, расположенной в срединной плоскости. Ротовая полость ограничена костными стенками только сверху, спереди и с боков. На боковой поверхности черепа находятся крыловидно-небная, подвисочная и височная ямки.